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Bioinformatiker*in (m/w/d)/Data Scientist (m/w/d)
Göttingen
Aktualität: 24.06.2024
Anzeigeninhalt:
24.06.2024, HAWK Hochschule für angewandte Wissenschaft und Kunst
Göttingen
Bioinformatiker*in (m/w/d)/Data Scientist (m/w/d)
Ihre Aufgaben:
Etablierung eines schlüssigen Analyse-Workflows von Long-Read-Sequenzierungsergebnissen in Zusammenarbeit mit Naturwissenschaftler*innen (m/w/d) sowie Benchmarking von Pipelines für die Vorverarbeitung und Analyse von DNA-Datensätzen (GWAS, WES, WGS)
Vorbereitung der Analyse und Validierung von Genomsequenzierungsergebnissen
Entwicklung und Implementierung von neuen bioinformatischen Arbeitsabläufen
Durchführung von funktionellen und strukturellen genomischen Analysen zur Beantwortung molekularbiologischer/biomedizinischer Fragestellungen
Verantwortung für die bioinformatische Analyse von Rohdaten der Nanoporen-Sequenzierung, Klassifizierung der Daten nach dem aktuellen Stand der Forschung und Erweiterung der Analysemethodik in Bezug auf Basecalling und Identifizierung von Modifikationen
Das bringen Sie mit:
Abgeschlossenes Studium (Master, Diplom, Promotion) im Bereich Computational Biology, Bioinformatik, Informatik, Biologie oder einer verwandten Disziplin mit einschlägiger Berufserfahrung in den Bereichen Genomik, NGS (Next Generation Sequencing) und Bioinformatik
Praktische Erfahrung in der Analyse von NGS-Daten (insbesondere Nanopore-Long-Read-Sequenzierung) und der Entwicklung bioinformatischer Methoden in diesem Arbeitsbereich
Solide Programmiererfahrung und umfassende Kenntnisse in der Verwendung gängiger Skriptsprachen (R, Python, C++ usw.) sowie Hintergrundwissen im Bereich Deep-Learning-Netztraining
Erfahrung mit Git, Linux, mit Hochleistungsrechnern sowie in der Vorverarbeitung und Analyse von Hochdurchsatzdaten
Kenntnisse über statistische Methoden im Zusammenhang mit biologischen Systemen
Wünschenswert
Erfahrung im Umgang mit biologischen Datenbanken
Fachwissen über Transkriptomik-, Proteomik- oder Multiomik-Daten
Kenntnisse im Aufbau von Analysepipelines (Snakemake, Nextflow)
Begeisterung für die Genomanalyse im Rahmen der Grundlagenforschung und Interesse an deren Weiterentwicklung
Unterstützung bei der Analyse und Interpretation von Bulk- und Single-Cell-Sequenzierungsdaten sowie der Formulierung von weiteren Hypothesen/Forschungsfragen
Es besteht die Möglichkeit zur Promotion.
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